Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCG1P45844 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCG1P45844 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCG1P45844 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms