Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD52P43351 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAD52P43351 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAD52P43351 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAD52P43351 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAD52P43351 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAD52P43351 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAD52P43351 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD52P43351 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD52P43351 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD52P43351 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAD52P43351 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAD52P43351 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms