Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFSF9P41273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms