Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HADHAP40939 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HADHAP40939 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHAP40939 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHAP40939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHAP40939 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHAP40939 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HADHAP40939 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HADHAP40939 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HADHAP40939 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HADHAP40939 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHAP40939 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHAP40939 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHAP40939 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HADHAP40939 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HADHAP40939 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HADHAP40939 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HADHAP40939 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms