Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THPOP40225 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THPOP40225 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THPOP40225 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THPOP40225 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THPOP40225 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
THPOP40225 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
THPOP40225 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THPOP40225 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THPOP40225 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THPOP40225 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THPOP40225 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THPOP40225 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THPOP40225 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THPOP40225 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THPOP40225 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THPOP40225 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THPOP40225 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THPOP40225 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THPOP40225 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THPOP40225 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THPOP40225 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THPOP40225 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THPOP40225 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THPOP40225 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
THPOP40225 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THPOP40225 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms