Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSPA9P38646 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HSPA9P38646 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HSPA9P38646 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms