Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNN1AP37088 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SCNN1AP37088 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNN1AP37088 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms