Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MYH11P35749 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYH11P35749 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYH11P35749 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYH11P35749 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYH11P35749 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYH11P35749 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYH11P35749 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYH11P35749 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYH11P35749 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYH11P35749 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYH11P35749 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYH11P35749 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYH11P35749 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYH11P35749 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYH11P35749 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYH11P35749 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYH11P35749 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYH11P35749 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYH11P35749 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYH11P35749 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYH11P35749 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYH11P35749 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYH11P35749 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYH11P35749 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYH11P35749 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MYH11P35749 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MYH11P35749 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MYH11P35749 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MYH11P35749 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MYH11P35749 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH11P35749 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MYH11P35749 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms