Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNA1P35221 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNA1P35221 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA1P35221 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA1P35221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms