Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM4P33991 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM4P33991 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM4P33991 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM4P33991 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM4P33991 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM4P33991 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM4P33991 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM4P33991 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MCM4P33991 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM4P33991 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM4P33991 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM4P33991 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM4P33991 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM4P33991 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM4P33991 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM4P33991 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM4P33991 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM4P33991 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM4P33991 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM4P33991 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM4P33991 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM4P33991 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCM4P33991 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms