Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH5P33151 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH5P33151 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH5P33151 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH5P33151 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH5P33151 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH5P33151 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH5P33151 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH5P33151 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH5P33151 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH5P33151 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH5P33151 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH5P33151 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH5P33151 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH5P33151 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH5P33151 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH5P33151 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH5P33151 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH5P33151 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH5P33151 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH5P33151 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH5P33151 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH5P33151 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH5P33151 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH5P33151 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH5P33151 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH5P33151 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH5P33151 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH5P33151 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH5P33151 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH5P33151 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH5P33151 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms