Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCR5P32302 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCR5P32302 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCR5P32302 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms