Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCKARP32238 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCKARP32238 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCKARP32238 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCKARP32238 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCKARP32238 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCKARP32238 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCKARP32238 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCKARP32238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCKARP32238 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCKARP32238 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCKARP32238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.5 ms