Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIBADHP31937 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HIBADHP31937 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIBADHP31937 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms