Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CLIP1P30622 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
CLIP1P30622 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLIP1P30622 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms