Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5AP29375 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5AP29375 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5AP29375 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5AP29375 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5AP29375 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5AP29375 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5AP29375 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5AP29375 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5AP29375 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms