Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SHC1P29353 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SHC1P29353 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SHC1P29353 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHC1P29353 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHC1P29353 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHC1P29353 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHC1P29353 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHC1P29353 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHC1P29353 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHC1P29353 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHC1P29353 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHC1P29353 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHC1P29353 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHC1P29353 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHC1P29353 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHC1P29353 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHC1P29353 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHC1P29353 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHC1P29353 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHC1P29353 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms