Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB2P29323 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHB2P29323 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHB2P29323 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms