Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR1EP28566 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR1EP28566 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms