Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGAT1P26572 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGAT1P26572 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGAT1P26572 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms