Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO1P25800 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO1P25800 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO1P25800 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMO1P25800 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMO1P25800 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMO1P25800 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO1P25800 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMO1P25800 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMO1P25800 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMO1P25800 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMO1P25800 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMO1P25800 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LMO1P25800 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LMO1P25800 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LMO1P25800 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LMO1P25800 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LMO1P25800 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LMO1P25800 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms