Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YY1P25490 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YY1P25490 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
YY1P25490 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
YY1P25490 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
YY1P25490 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YY1P25490 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YY1P25490 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YY1P25490 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
YY1P25490 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
YY1P25490 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YY1P25490 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
YY1P25490 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YY1P25490 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
YY1P25490 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
YY1P25490 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
YY1P25490 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
YY1P25490 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YY1P25490 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
YY1P25490 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YY1P25490 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
YY1P25490 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
YY1P25490 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
YY1P25490 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
YY1P25490 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
YY1P25490 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
YY1P25490 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YY1P25490 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
YY1P25490 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
YY1P25490 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
YY1P25490 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YY1P25490 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
YY1P25490 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
YY1P25490 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
YY1P25490 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
YY1P25490 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
YY1P25490 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
YY1P25490 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YY1P25490 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YY1P25490 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
YY1P25490 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
YY1P25490 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
YY1P25490 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
YY1P25490 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
YY1P25490 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
YY1P25490 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms