Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDELR1P24390 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDELR1P24390 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDELR1P24390 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms