Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP24386 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP24386 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP24386 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP24386 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP24386 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP24386 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP24386 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHMP24386 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP24386 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP24386 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHMP24386 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHMP24386 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP24386 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP24386 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP24386 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP24386 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms