Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF4BP23588 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EIF4BP23588 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms