Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 NUP160-209ENST00000530326 4811 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.99□□□□□ -1.453e-6■■■■■ 36.2
RPS3P23396 OSTM1-203ENST00000467960 764 ntTSL 323.13■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 ANTXR1-204ENST00000463335 1437 ntTSL 1 (best)20.56■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.696e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.636e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 317.75■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-207ENST00000531140 767 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-205ENST00000527762 589 ntTSL 415.48■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-209ENST00000534455 921 ntTSL 215.46■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-213ENST00000592732 795 ntTSL 314.71□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SPON2-213ENST00000509697 886 ntTSL 314.68□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-210ENST00000590808 777 ntTSL 513.34□□□□□ -0.276e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-207ENST00000589438 1033 ntTSL 313.14□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 212.91□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 FBXL12-209ENST00000590277 581 ntTSL 312.55□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 SC5D-203ENST00000524683 2391 ntTSL 29.34□□□□□ -0.916e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 OSTM1-202ENST00000440575 724 ntTSL 58.3□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 EPAS1-204ENST00000463191 559 ntTSL 26.5□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 36.2
RPS3P23396 COX7B-202ENST00000475465 685 ntTSL 28.72□□□□□ -1.015e-9■■■■■ 36.2
RPS3P23396 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 28.96□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 36.2
RPS3P23396 GGH-208ENST00000523788 492 ntTSL 220.62■□□□□ 0.895e-18■■■■■ 36.1
RPS3P23396 GGH-204ENST00000518966 574 ntTSL 215.77■□□□□ 0.125e-18■■■■■ 36.1
RPS3P23396 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.019e-36■■■■■ 36.1
RPS3P23396 PCCB-203ENST00000462542 488 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 36.1
RPS3P23396 PCCB-205ENST00000465176 570 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 36.1
RPS3P23396 PCCB-202ENST00000459873 534 ntTSL 49.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 36.1
RPS3P23396 ACO2-204ENST00000471094 699 ntTSL 321.91■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 36
RPS3P23396 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 36
RPS3P23396 HIST4H4-201ENST00000358064 1918 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.773e-10■■■■■ 36
RPS3P23396 ATP5C1-204ENST00000460820 622 ntTSL 211.74□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 36
RPS3P23396 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.092e-10■■■■■ 36
RPS3P23396 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.522e-10■■■■■ 36
RPS3P23396 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-10■■■■■ 36
RPS3P23396 BCAM-202ENST00000588303 914 ntTSL 320.2■□□□□ 0.826e-14■■■■■ 36
RPS3P23396 BCAM-203ENST00000588603 904 ntTSL 217.17■□□□□ 0.346e-14■■■■■ 36
RPS3P23396 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 28.26□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 36
RPS3P23396 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 36
RPS3P23396 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-208ENST00000629751 1034 ntTSL 217.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-206ENST00000602786 3488 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 HSPH1-209ENST00000630972 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 36
RPS3P23396 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 SEMA7A-205ENST00000569617 473 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.591e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-210ENST00000607361 754 ntTSL 224.06■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.411e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 11e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 RPP21-225ENST00000466327 697 ntTSL 320.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.876e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 220.24■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.626e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CISD2-203ENST00000574446 471 ntTSL 518.56■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 NUBPL-208ENST00000550649 557 ntTSL 518.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-207ENST00000443704 1783 ntTSL 517.46■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.296e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-206ENST00000444450 888 ntTSL 516.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 SAFB2-204ENST00000589925 506 ntTSL 316.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 UNG-205ENST00000540158 498 ntTSL 216.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 35.9
RPS3P23396 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 35.9
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