Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHCGRP22888 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHCGRP22888 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LHCGRP22888 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LHCGRP22888 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHCGRP22888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms