Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKACGP22612 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRKACGP22612 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKACGP22612 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms