Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C4BPBP20851 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4BPBP20851 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4BPBP20851 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms