Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA5P20719 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms