Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5AP20339 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5AP20339 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5AP20339 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms