Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB3BP20337 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB3BP20337 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms