Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2EP19388 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR2EP19388 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms