Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDH2P19022 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH2P19022 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH2P19022 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH2P19022 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH2P19022 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH2P19022 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH2P19022 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH2P19022 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH2P19022 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH2P19022 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH2P19022 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH2P19022 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH2P19022 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH2P19022 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH2P19022 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH2P19022 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH2P19022 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH2P19022 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH2P19022 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH2P19022 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH2P19022 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH2P19022 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH2P19022 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH2P19022 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH2P19022 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH2P19022 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms