Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
XRCC1P18887 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XRCC1P18887 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XRCC1P18887 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms