Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RCC1P18754 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RCC1P18754 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCC1P18754 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCC1P18754 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCC1P18754 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RCC1P18754 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCC1P18754 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCC1P18754 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCC1P18754 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RCC1P18754 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RCC1P18754 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RCC1P18754 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RCC1P18754 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RCC1P18754 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RCC1P18754 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RCC1P18754 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RCC1P18754 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RCC1P18754 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RCC1P18754 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RCC1P18754 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RCC1P18754 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RCC1P18754 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms