Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR1P18146 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR1P18146 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR1P18146 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR1P18146 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR1P18146 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR1P18146 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR1P18146 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR1P18146 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR1P18146 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR1P18146 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR1P18146 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EGR1P18146 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR1P18146 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR1P18146 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EGR1P18146 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EGR1P18146 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR1P18146 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EGR1P18146 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms