Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERCC2P18074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERCC2P18074 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERCC2P18074 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERCC2P18074 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms