Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB9P17482 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms