Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSPP15924 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSPP15924 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSPP15924 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSPP15924 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSPP15924 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSPP15924 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSPP15924 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSPP15924 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSPP15924 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSPP15924 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSPP15924 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSPP15924 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSPP15924 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSPP15924 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSPP15924 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
DSPP15924 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSPP15924 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSPP15924 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSPP15924 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSPP15924 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSPP15924 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSPP15924 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DSPP15924 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DSPP15924 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms