Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC130P13994 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC130P13994 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC130P13994 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms