Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDGF1P13385 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDGF1P13385 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDGF1P13385 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms