Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4P13236 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4P13236 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4P13236 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCL4P13236 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCL4P13236 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCL4P13236 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL4P13236 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4P13236 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4P13236 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4P13236 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4P13236 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL4P13236 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4P13236 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4P13236 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4P13236 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4P13236 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL4P13236 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL4P13236 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL4P13236 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL4P13236 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL4P13236 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCL4P13236 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCL4P13236 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms