Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HARSP12081 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARSP12081 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARSP12081 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARSP12081 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HARSP12081 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARSP12081 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HARSP12081 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HARSP12081 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HARSP12081 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HARSP12081 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HARSP12081 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARSP12081 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARSP12081 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HARSP12081 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARSP12081 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARSP12081 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARSP12081 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARSP12081 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HARSP12081 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HARSP12081 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HARSP12081 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HARSP12081 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARSP12081 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARSP12081 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARSP12081 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HARSP12081 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HARSP12081 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HARSP12081 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HARSP12081 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HARSP12081 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HARSP12081 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HARSP12081 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARSP12081 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARSP12081 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HARSP12081 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms