Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFHP12036 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFHP12036 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEFHP12036 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFHP12036 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFHP12036 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEFHP12036 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFHP12036 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFHP12036 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFHP12036 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFHP12036 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFHP12036 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFHP12036 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms