Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TOP1P11387 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TOP1P11387 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TOP1P11387 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1P11387 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1P11387 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1P11387 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TOP1P11387 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TOP1P11387 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TOP1P11387 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TOP1P11387 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOP1P11387 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOP1P11387 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TOP1P11387 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP1P11387 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP1P11387 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TOP1P11387 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TOP1P11387 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1P11387 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1P11387 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TOP1P11387 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TOP1P11387 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms