Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41P11171 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41P11171 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41P11171 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41P11171 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41P11171 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41P11171 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41P11171 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41P11171 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41P11171 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41P11171 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41P11171 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41P11171 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41P11171 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41P11171 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41P11171 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41P11171 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41P11171 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41P11171 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41P11171 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41P11171 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41P11171 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41P11171 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41P11171 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41P11171 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41P11171 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPB41P11171 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41P11171 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41P11171 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms