Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
LAMC1P11047 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LAMC1P11047 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMC1P11047 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMC1P11047 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMC1P11047 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms