Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR2MP0CAP2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR2MP0CAP2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR2MP0CAP2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms