Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP2P08253 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP2P08253 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP2P08253 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP2P08253 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP2P08253 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP2P08253 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP2P08253 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP2P08253 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP2P08253 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP2P08253 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP2P08253 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP2P08253 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP2P08253 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP2P08253 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP2P08253 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms